Projekty
Projekt CAMO3E
Pokročilé zobrazovanie v skorej diagnostike nádorov ezofágu
Kód projektu: 401101F618
Akronym: CAMO3E
Projekt CAMO3E je zameraný na vývoj a verifikáciu inovatívnych multimodálnych zobrazovacích prístupov pre skorú diagnostiku nádorov ezofágu. Prostredníctvom integrácie pokročilých optických a biofotonických technológií, metód umelej inteligencie a predklinických modelov vytvára platformu na identifikáciu nových zobrazovacích biomarkerov a zlepšenie diagnostických postupov. Projekt prispeje k rozvoju špičkového biomedicínskeho výskumu na Univerzite Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach, posilní jej výskumnú infraštruktúru v oblasti pokročilého zobrazovania a podporí medzinárodnú spoluprácu vo výskume, vývoji a inováciách. Výsledky projektu vytvoria predpoklady pre efektívnejší transfer moderných diagnostických technológií do klinicky orientovaného výskumu a personalizovanej medicíny. Projekt je spolufinancovaný Európskou úniou v Programe SLOVENSKO: Podpora medzinárodnej spolupráce v oblasti výskumu, vývoja a inovácií – Doména Zdravá spoločnosť.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Veronika Huntošová, PhD.
Doba trvania projektu: 01/07/2026 – 30/06/2028
BioPickmol
Vývoj nanosenzorických fotonických systémov na rýchlu detekciu vírusov využitím metód riadenej evolúcie proteínovýchplatforiem: prípad SARS-CoV-2
Funkcionalizácia povrchu čipu nanovrstvou molekúl špecifických proteínov vyvinutých metódou riadenej evolúcie vybraných proteínových platforiem. Tvorba nanovrstiev proteínov na detekčnom čipe bude prebiehať pomocou kontrolovanej špecifickej chemickej konjugácie, čim dosiahneme optimálnu efektivitu viazania a reprodukovateľnosť detekčných vlastností. Po nanesení vzorky inaktivovaného vírusu na funkcionalizovaný čip bude prítomnosť vírusu detegovaná na základe zosilneného ramanovského spektra povrchovými plazmónmi. Na detekciu signálu z funkcionalizovaných čipov bude vyvinutý detekčný systém bioRAMASCOPE. bioRAMASCOPE bude spĺňať špecifické požiadavky týkajúce sa detekčných limitov a spoľahlivosti prevádzky vyžadovaných pre detekciu vírusu SARS-CoV-2. Pomocou moderných selekčných metód proteínového inžinierstva sa budú vyvíjať artificiálne proteíny ako nové biologické entity s väzobnou funkciou, ktorá sa špecializuje na špecifické viazanie inaktivovaných vírusov. Na základe kombinácie viazania rôznych epitopov plánujeme dosiahnúť vysokú citlivosť a špecificitu vyselektovaných proteínových platforiem voči rôznym typom vírusov, vrátane SARS-CoV-2.
Hlavný riešiteľ: UPJŠ, doc. RNDr. Gabriel Žoldák, PhD.
Doba trvania projektu: 01/2021 – 06/2023
OPENMED
Otvorená vedecká komunita pre moderný interdisciplinárny výskum v medicíne (OPENM
ED)
Projekt OPENMED si stanovil za prioritné ciele riešenie vybraných problémov diagnostiky a liečby onkologických, kardiovaskulárnych a vírusových ochorení, ochorení centrálneho nervového systému a pohybového aparátu. Na projekte sa podieľajú Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach (UPJŠ), Technická univerzita v Košiciach (TUKE), Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach (UVLF), Neurobiologický ústav Biomedicínskeho centra SAV (NbÚ BMC SAV) a dvaja partneri z priemyselného sektora - MM MEDICAL s.r.o. a JUHAPHARM s.r.o.. Jedinečnosť a originalita projektu OPENMED spočíva v účelnom využití multidisciplinárneho prostredia košických univerzít a vedeckovýskumných pracovísk, ktoré prepája vzájomne sa dopĺňajúca expertíza v oblasti medicíny, prírodných a technických vied a veterinárneho lekárstva. Toto prepojenie spolu s ambicióznym zámerom transferu technológií vytvára jedinečný ekosystém biomedicínskeho výskumu na Slovensku. Intenzívna interdisciplinárna spolupráca projektových partnerov vyústila do vytvorenia moderných výskumných oblastí prepájajúcich nové biomedicínske odbory, konkrétne: i) nanomedicínu a cielenú terapiu, ii) personalizovanú medicínu a iii) regeneratívnu medicínu a bunkovú terapiu. Celkovým cieľom projektu je vytvoriť v rámci konzorcia OPENMED jedinečný ekosystém tvorený vzájomne sa dopĺňajúcou vedeckovýskumnou biomedicínskou infraštruktúrou a vysokokvalifikovaným odborným personálom. Uplatnenie získaných výsledkov výskumu v praxi prispeje k zlepšeniu diagnostických a terapeutických postupov pri uvedených závažných civilizačných ochoreniach, a tým aj k zlepšeniu zdravotného stavu obyvateľstva.
Hlavný riešiteľ: doc. Mgr. Daniel Jancura, PhD.
Doba trvania projektu: 1.11.2019 – 30.6.2023
CasProt
Podpora vysokej vedeckej kvality v oblasti proteínových vied na východnom Slovensku (CasProt)
Cieľ projektu: Hlavným cieľom projektu je posilniť vedecké kapacity a rozvinúť výskumný potenciál UPJŠ v Košiciach v oblasti proteínových vied. Realizácia projektu bude trvať tri roky a zapoja sa do nej špičkové výskumné tímy partnerských inštitúcií - Technickej univerzity v Mníchove a Univerzity v Zürichu. Projekt prispeje k rozvoju technológií a zvýšeniu inovačného potenciálu UPJŠ v Košiciach s očakávaným dosahom na východné Slovensko aj celú krajinu. Výsledky výskumu prispejú k pochopeniu molekulárnych mechanizmov regulácie funkcie receptorov spriahnutých s G proteínmi (GPCR) a k zdokonaleniu racionálnych prístupov k cielenému vývoju nových liečiv. Projekt zároveň významne podporuje mladých vedcov pri rozvoji zručností v oblasti interdisciplinárnych biovied. Jednou z jeho ambícií je tiež prilákať späť skúsených slovenských vedcov dlhodobo pôsobiacich v zahraničí. Očakáva sa, že výsledky projektu povedú k získaniu patentu, založeniu startupovej spoločnosti a nadviazaniu kontaktov s významnými priemyselnými spoločnosťami.
CELIM
Projekt „Podpora excelentnosti v zobrazovaní buniek na viacerých priestorových úrovniach“ (CELIM), realizovaný v rámci 7. rámcového programu EÚ (REGPOT), je zameraný na posilnenie výskumného potenciálu Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach. Tento cieľ sa má dosiahnuť rozšírením existujúcej siete spolupráce s vybranými špičkovými európskymi partnermi v oblasti zobrazovania buniek, obstaraním novej technickej infraštruktúry a podporou návratu a opätovného začlenenia skúsených slovenských vedcov pôsobiacich v zahraničí.
Konzorcium pre pokročilé proteínové biotechnológie: model podpory hospodárskeho rastu a zmierňovania odlivu mozgov na východnom Slovensku
Kód projektu: 09I02-03-V01-00021
Akronym/Acronym: APBC
Konzorcium pre pokročilé proteínové biotechnológie (APBC) je projekt zameraný na rozvoj modelu medzinárodnej spolupráce vo výskume a vývoji so špičkovými akademickými partnermi. Jeho cieľom je prispieť k riešeniu hospodárskych a spoločenských výziev na Slovensku a zároveň účinne zmierňovať odlev mozgov z východného Slovenska. Projekt APBC je strategicky navrhnutý tak, aby podporoval udržateľný rozvoj využitím potenciálu proteínových biotechnológií. Vytvára podmienky na vznik duševného vlastníctva v tejto oblasti a v dlhodobom horizonte aj na prilákanie biotechnologických výrobných prevádzok. Zameraním na túto perspektívnu oblasť chce konzorcium podporiť hospodársky rast, vytvárať pracovné príležitosti vyžadujúce vysokú kvalifikáciu a posilniť celkovú konkurencieschopnosť Slovenska v biotechnologickom priemysle. APBC tak predstavuje modelový koncept na overenie uskutočniteľnosti takéhoto prístupu k riešeniu významných výziev na Slovensku. Očakávame, že naša iniciatíva bude inšpiráciou aj pre ďalšie priemyselné odvetvia.
Hlavný riešiteľ: prof. RNDr. Erik Sedlák, DrSc.
Doba trvania: 03/2025-08/2027
Skúmanie štruktúrnych vlastností a terapeutického potenciálu substrát viažucej domény chaperónu Hsp70 pri liečbe amyloidózy
Kód projektu: 09I03-03-V04-00116
Amyloidóza je skupina ochorení charakterizovaných nesprávnym skladaním a agregáciou ľahkých reťazcov, čo vedie k ich ukladaniu v rôznych tkanivách. To narúša ich funkčnosť a spôsobuje závažné zdravotné komplikácie. Napriek závažnosti amyloidózy v súčasnosti neexistuje účinná liečba zameraná na potlačenie agregácie ľahkých reťazcov. V tomto projekte plánujeme objasniť štruktúrne vlastnosti a terapeutický potenciál substrát viažucej domény chaperónu Hsp70 ako novej stratégie boja proti amyloidóze. Na dosiahnutie tohto cieľa využijeme kombináciu techník molekulárnej biológie, biofyziky a štruktúrnej biológie. Pridaná hodnota projektu spočíva v etablovaní proteínovej kryštalografie ako novej vedeckej disciplíny na UPJŠ, a to na praktickej aj teoretickej úrovni.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Michal Nemergut, PhD.
Doba trvania: 07/2024 – 06/2026
Organoid karcinómu prsníka na čipe na zobrazovanie autofágie a apoptózy indukovaných cielenou liečbou pomocou navrhnutého proteínu s ankyrínovými opakovaniami meraním doby života fluorescencie
Kód projektu: 09I03-03-V04-00007
Doba života fluorescencie je jedinečný parameter molekuly, ktorý je veľmi citlivý na prostredie. Zobrazovanie doby života fluorescencie preto umožňuje identifikovať lokálne zmeny v bunkách s vysokým priestorovým a časovým rozlíšením. Nahradenie zvieracích modelov ľudských ochorení je jednou z hlavných priorít nášho výskumu. Cieľom tohto projektu je vytvoriť organoid karcinómu prsníka zložený z buniek s rôznou úrovňou expresie receptora ľudského epidermálneho rastového faktora 2 na sledovanie subcelulárnych a bunkových interakcií počas cielenej liečby. Organoid tak vykazuje vysoký stupeň heterogenity a premosťuje medzeru medzi bunkovými kultúrami a modelmi rakoviny in vivo. Na pestovanie buniek na čipe sa navrhuje inovatívny prístup využívajúci hydrogélovú nosnú štruktúru z rekombinantných proteínov pavúčieho hodvábu. Na bunky na čipe je zacielený nanotransportný systém pozostávajúci z nanočastíc na báze kovov a navrhnutého proteínu s ankyrínovými opakovaniami. Zloženie nanočastíc umožňuje multimodálne biozobrazovanie a liečbu.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Veronika Huntošová, PhD.
Doba trvania: 07/2024 – 06/2026
Racionálny dizajn stabilnej a katalyticky účinnej haloalkándehalogenázy DhaA
Kód projektu: 09I03-03-V04-00112
Haloalkándehalogenázy (HLD) sú známe ako mikrobiálne enzýmy schopné rozkladať syntetické halogénované zlúčeniny, ktoré sa považujú za znečisťujúce látky. Tri archetypálne enzýmy (DhlA, DhaA a LinB) boli podrobne skúmané a modifikované metódami proteínového inžinierstva. Získanie kvalitatívnych vlastností HLD požadovaných pre biotechnologické využitie však pre výskumníkov stále predstavuje významnú prekážku. Tento projekt prináša originálne riešenie na možné zvýšenie stability a katalytickej aktivity skupiny haloalkándehalogenáz. Hlavným prínosom bude vytvorenie metodiky na efektívne zlepšenie vlastností HLD kombináciou metód racionálneho dizajnu a evolúcie proteínov. Na preukázanie účinnosti navrhovaného prístupu bude ako zástupca HLD vybraná dobre charakterizovaná haloalkándehalogenáza DhaA.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Ivana Timková, PhD.
Doba trvania: 9/2024-6/2026
ExCasProt
Podpora rozvoja biotechnologického výskumu proteínov na východnom Slovensku
Fostering high scientific quality in protein research in Eastern Slovakia
Kód projektu: 09I01-03-V04-00041
Hlavým cieľom predkladaného projektu ExCasProt je pomocou metód riadenej evolúcie vyvinúť a identifikovať solubilné analógy GPCR proteínov, čo povedie k jednoduchšej manipulácii s nimi, lepšiemu pochopeniu ich štruktúry a funkcie. Receptory spojené s G-proteínmi (GPCR) predstavujú dôležitú skupinu membránových proteínov. V organizme zohrávajú kľúčovú úlohu a narušenie ich signálnej dráhy je spojené s množstvom ochorení, preto sú relevantným cieľom farmaceutického priemyslu. Dizajn liečiv založený na detailnom poznaní štruktúry komplexov proteín-ligand je jedným z najefektívnejších prístupov v súčasnom výskume liekov. U GPCR je počet dostupných štruktúr obmedzený v dôsledku nedostatku štruktúrnych údajov spôsobených komplikáciami súvisiacimi s ich produkciou a izoláciou v natívnej forme. Hlavým cieľom predkladaného projektu ExCasProt je pomocou metód riadenej evolúcie vyvinúť a identifikovať solubilné analógy GPCR proteínov, čo povedie k jednoduchšej manipulácii s nimi, lepšiemu pochopeniu ich štruktúry a funkcie. Úspech v konkrétnom prípade nám poslúži ako dôkaz princípu, ktorý by mohol byť aplikovateľný aj na ďalšie proteíny z triedy GPCR.
Hlavný riešiteľ: Mgr. Mária Tomková, PhD.
Doba trvania: 2/2024 – 6/2026
Vývoj luciferázy so zvýšenou svietivosťou pomocou kvasinkového bioluminiscenčného systému
Hlavným cieľom tohto projektu je vyvinúť variant luciferázy so zvýšenou svietivosťou, ktorá by dokázala konkurovať komerčne dostupných luciferázam. Vývoj takejto luciferázy bude založený na riadenej evolúcii luciferázy pochádzajúcej z huby Neonothopanus nambi, ktorá je zatiaľ jediná eukaryotická luciferáza, u ktorej bola identifikovaná metabolická cesta syntézy jej prirodzeného substrátu. Dosiahnutie tohto cieľa spočíva vo vytvorení geneticky upraveného kvasinkového systému, ktorý umožní produkciu daného substrátu ako aj sledovanie interakcie medzi luciferázou a substrátom priamo v kvasinke.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Michal Nemergut, PhD.
Doba trvania: 1/2025 – 12/2027
Vývoj a optimalizácia bakteriálneho expresného systému patologických foriem ľudského ľahkého reťazca imunoglobulínu IgG (VEGA 1/0024/22)
Bakteriálna produkcia rekombinantých proteínov zohráva dôležitú úlohu v základnom výskume pochopenia molekulovej podstaty patologických foriem ľudských proteínov. Okrem výskumu sú tieto rekombinantné proteíny potrebné pre efektívny vývoj diagnostických platforiem. Existencia veľkého množstva vhodných expresných vektorov ako aj jednoduchá kultivácia baktérií E. coli umožňuje škálovateľnú produkciu proteínov. V tomto projekte sa v prvom kroku zameriame na optimalizáciu expresie verejne dostupných patologických foriem ľahkého reťazca imunoglobulínu G v E. coli. V druhom kroku pripravíme pomocou techník molekulovej biológie nové tandemové proteínové konštrukty obsahujúce patologicky ľahký reťazec, ktorý je kovalentne spojený s proteínom patriacim do skupiny tzv. solubility enhancer tag. Štúdiom vplyvu 5 rôznych druhov solubility enhancerov (SUMO, MBP, SlyD, GB1 a GST) na rozsah expresie ľahkého reťazca získame optimálny bakteriálny expresný systém.
Hlavný riešiteľ: UPJŠ, doc. RNDr. Gabriel Žoldák, DrSc.
Doba trvania: 01/2022 – 12/2024
Štúdium a modifikácia vlastností pavúčieho proteínu nadmerne exprimovaného v Escherichia coli
Ciele projektu: 1) zaviesť kontrolovateľné samousporiadanie pavúčieho proteínu prístupom „zdola nahor“; a 2) vytvoriť nanokompozity na báze pavúčieho proteínu a amyloidu na biomedicínske a biotechnologické aplikácie. Projekt je výsledkom spolupráce so skupinou RNDr. Ing. Kataríny Šipošovej, PhD., zo Slovenskej akadémie vied.
Hlavný riešiteľ: doc. RNDr. Erik Sedlák, DrSc.
Doba trvania: 2022-2025
Modifikácia katalytických vlastností haloalkándehalogenáz metódami evolúcie proteínov
Ciele projektu: Vyvinúť stabilné analógy HLD s katalytickými vlastnosťami vhodnými na biotechnologické aplikácie pomocou metódy riadenej evolúcie proteínov - Ribozómového displeja.
Hlavný riešiteľ: doc. RNDr. Erik Sedlák, DrSc.
Doba trvania: 2022-2024
Agregácia imunoglobulínov a predikcia ich koloidnej stability pomocou pokročilej kinetickej analýzy
Cieľ projektu: Stabilita imunoglobulínov G (IgG) je jednou z najdôležitejších vlastností ovplyvňujúcich úspešnosť klinického využitia imunoterapeutík. Získanie správnych parametrov opisujúcich stabilitu a agregáciu IgG je nepochybne veľmi ambicióznym cieľom, najmä vzhľadom na zložitosť ich štruktúr. V tomto projekte naša skupina vyvinie biofyzikálny model založený na analýze kinetiky inaktivácie IgG a mikrokalorimetrii pri zvýšených teplotách.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Gabriel Žoldák, PhD.
Doba trvania: 2019–2022
Časovo rozlíšené zobrazovanie spotreby kyslíka v nádorových bunkách počas fotodynamickej terapie
Cieľ projektu: Hlavným cieľom projektu je zavedenie časovo rozlíšených meraní na analýzu metabolických procesov počas fotodynamickej terapie (PDT) nádorových ochorení. Motivácia a ciele vychádzajú z odborných znalostí a vedeckých zručností členov tímu získaných v oblasti časovo rozlíšenej mikroskopie a spektroskopie a nových prístupov k spracovaniu obrazu (bootstrap a štatistická morfológia). Konkrétne ciele projektu sú: a) charakterizovať Sternove-Volmerove kalibračné krivky PpIX a RuPhen v roztoku pomocou časovo rozlíšených metód, b) sledovať subcelulárnu distribúciu PpIX a RuPhen po PDT a definovať terapeutický protokol, c) vytvoriť mapy oxygenácie nádorových buniek ošetrených PDT pomocou kalibračných kriviek PpIX alebo RuPhen a dôb života luminiscencie PpIX alebo RuPhen nameraných v živých bunkách. Využijeme jedinečnú zostavu na meranie doby života fluorescencie a fosforescencie v reálnom čase, dostupnú na CIB a KBF UPJŠ v Košiciach: mikroskopický systém FLIM/PLIM.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Veronika Huntošová, PhD.
Doba trvania: 2018-2020
Riadená evolúcia haloalkánových dehalogenáz so zlepšenou katalytickou aktivitou 
a stabilitou pomocou ribozómového displeja
Cieľ projektu: Haloalkánové dehalogenázy (HLD) sú hydrolázové enzýmy, ktoré katalyzujú štiepenie väzby medzi uhlíkom a halogénom, čím premieňajú toxické halogénované zlúčeniny na menej škodlivé látky. Enzymaticky sprostredkovaná dehalogenácia má široké uplatnenie v priemysle a významný potenciál v bioremediácii bežných environmentálnych znečisťujúcich látok. Praktické využitie HLD je však obmedzené najmä nedostatočnou stabilitou a nízkou katalytickou účinnosťou prirodzene sa vyskytujúcich enzýmov. Tieto komplexné vlastnosti enzýmov je možné zlepšiť pomocou efektívnych metód cielenej evolúcie proteínov. Cieľom tohto projektu je vyvinúť stabilné varianty haloalkánových dehalogenáz s katalytickými vlastnosťami vhodnými pre biotechnologické aplikácie. Na dosiahnutie tohto cieľa využijeme ribozómový displej ako účinnú metódu riadenej evolúcie proteínov. Vybrané varianty HLD budú následne detailne charakterizované s cieľom objasniť vplyv získaných mutácií na stabilitu a katalytickú výkonnosť enzýmov.
Hlavný riešiteľ: RNDr. Michal Nemergut, PhD.
Doba trvania projektu: 2026 -2030
Development of efficient genetically encoded photosensitizers
Project objective: The principal goal of this project is to develop a molecular method by which we will be able to transform unrelated flavoproteins into efficient photosensitizers producing singlet oxygen with a high quantum yield.
Principal Investigator: doc. RNDr. Erik Sedlák, DrSc.
Period: 2021–2025
Pochopenie mechanizmu inaktivácie IgG pomocou jednotlivých molekúl chaperónu Hsp70 a laserovej optickej pinzety (Hsp70sensor)
Cieľ projektu: Štruktúrna a biochemická zložitosť IgG, ako aj neobjasnený mechanizmus ich inaktivácie predstavujú významnú prekážku ich urýchleného vývoja a využitia v klinických aplikáciách. Hlavným problémom v počiatočných fázach výskumu a vývoja je najmä prirodzená tendencia protilátok strácať účinnosť v dôsledku neproduktívnych proteínovo-proteínových asociácií, ktoré sú pravdepodobne vyvolané lokálnym rozvinutím určitých kritických častí štruktúry IgG. V tomto projekte vyvinieme nový senzor založený na chaperóne Hsp70, ktorý umožní monitorovať vznik stavov IgG a jeho fragmentov náchylných na agregáciu.
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Gabriel Žoldák, PhD.
Obdobie riešenia: 2019–2023
Smerom k vysoko selektívnej liečbe rakoviny: komplexy endogénnych lipoproteínov a DARPin ako nová generácia nosičov na cielené doručovanie liečiv (DARLINK)
Cieľ projektu: Konečným cieľom projektu je vyvinúť novú generáciu nosičov liečiv (DARLINK) s vysokou kapacitou nákladu a výrazným potenciálom viazať sa s vysokou afinitou na špecifické receptory nádorových buniek. DARLINK možno prispôsobiť mutovaným receptorom nádorových buniek jednotlivých pacientov, a tým prispieť k personalizovanej liečbe rakoviny.
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Pavol Miškovský, DrSc.
Obdobie riešenia: 2016–2020
Premena integrálneho membránového proteínu na formu rozpustnú vo vode: prípad GPCR
Cieľ projektu: Hlavným cieľom projektu je overiť princíp možnosti premeny integrálneho membránového proteínu na jeho analóg rozpustný vo vode. Úspešné dosiahnutie tohto cieľa poskytne poznatky a nástroje na modifikáciu rozpustnosti aj ďalších, nielen membránových proteínov.
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Erik Sedlák, PhD.
Obdobie riešenia: 2016–2020
Záverečné hodnotenie: vynikajúce výsledky
Špecializované laboratórium pre výučbu a rozvoj proteínovej kryštalografie v prostredí virtuálnej reality
Primárnym cieľom tohto projektu je vytvoriť efektívnu infraštruktúru pre edukačné laboratórium, ktoré bude poskytovať materiálové, hardvérové a softvérové prostriedky pre praktickú výučbu a rozvoj proteínovej kryštalografie na UPJŠ. Účelom tohto laboratória bude poskytnúť študentom priaznivé interdisciplinárne prostredie, ktoré umožní získať a prehĺbiť si vedomosti a praktické zručnosti v oblasti výskumu proteínov využívajúc molekulárno-biologické a biochemické postupy, ako aj moderné interaktívne technológie, ako napríklad VR.
Hlavný riešiteľ: UPJŠ, RNDr. Michal Nemergut, PhD.
Doba trvania projektu: 1/2024 – 12/2026
KEGA eduLab – edukačné laboratórium lab-ona-chip technológie pre zrýchlenie inovácií diagnostických metód na Slovensku (005UPJŠ-4/2021)
Súčasná pandemická situácia radikálnym spôsobom zadefinovala nové špecifické požiadavky na výuku koncepčného vývoja diagnostických nástrojov s úlohou ochrany zdravia spoločnosti. Vývoj moderných diagnostických metód vyžaduje kombináciu biologického a teoreticko-experimentálneho fyzikálneho interdisciplinárneho prístupu, ktorý momentálne absentuje v akademickom prostredí.Cieľom projektu je poskytnúť inovatívne prostredie na výučbu lab-on-a-chip technológie (LoC),ktorá zahŕňa všetky dôležité štádia vývoja. Študenti sa budú postupne venovať základným princípom mikrofluidných zariadení a ich fyzikálnemu modelovaniu, skonštruujú vlastné lab-on-a-chip zariadenia so schopnosťou laserovej optickej manipulácie mikročastíc a vyhodnocovaním nameraných dát. Nástroje a zariadenie laboratória umožnia študentom získať praktické a teoretické zručnosti pre komplexné zvládnutie moderných lab-on-a-chip technológií s potenciálnou možnosťou pre vývoj vlastných aplikácií, napr. v oblasti diagnostiky v biomedicíne.
Hlavný riešiteľ: UPJŠ, doc. RNDr. Gabriel Žoldák, PhD.
Doba trvania projektu: 01/2021 – 12/2023
Hémový proteín v akcii: nové poznatky o jeho biológii z teórie a experimentov
Ciele projektu: Hémové proteíny predstavujú významnú triedu proteínov, ktoré zabezpečujú viaceré kľúčové životné procesy. Atóm železa v héme týchto proteínov vykazuje výraznú väzbovú preferenciu voči niektorým ligandom, ktoré sú príčinou klinických komplikácií, ako sú otrava CO a hypoxia. Naším cieľom je pomocou ultrarýchlych röntgenových techník objasniť časovo rozlíšené mechanistické detaily procesu väzby ligandov v hémovom proteíne.
Hlavný riešiteľ: Dr. Krishna Khakurel, Fyzikálny ústav AV ČR, ELI Beamlines, Za Radnicí 835, Dolní Břežany, 252 41, Česká republika
Slovenský partner: UPJŠ, doc. RNDr. Gabriel Žoldák, DrSc.
Doba trvania projektu: 02/2023 – 06/2024
Euro‐BioImaging is a large‐scale pan‐European research infrastructure project on the European Strategy Forum on Research Infrastructures (ESFRI) Roadmap. Preparatory Phase of the project lasted from Dec 2010 to May 2014 and was funded by the EC. Euro-BioImaging is now in the interim phase, with representatives of 12 countries and EMBL as international organisation working together towards the implementation of the infrastructure.